（1）全自動裝盒機速度受限于下說明書和下藥板的速度，設計應更加合理；

（2）全自動裝盒機長時間高速運行后穩定性比較差，要求運行平穩，多使用伺服系統；

（3）長時間運行后精度達不到要求，同步性不好，要求提高可靠性；

（4）對產品的適應性低，其功能比較單一，適應面比較窄，對待裝的藥品的形狀體積等有較嚴格的規定；

（5）設備運行可靠性不高，需要經常維修而影響生產進度；

（6）生產效率不高，運行速度慢，自動化程度不高；

（7）全自動裝盒機對說明書的尺寸偏差很敏感，例如對說明書的尺寸偏差要求應小于±0.5 mm，在日常生產中會出現因為說明書較薄而卡機的現象。有時會因為紙盒的尺寸出現略微的變化而造成紙盒不易被打開或者卡機的現象。